身為小村醫的韋小寶從小與傻子姐姐韋朵朵相依為命，一次意外，讓他獲得了藥神的傳承。本打算這輩子悠閑的治治病，種種菜，養養豬，弄弄古玩，再隨便指點指點那些慕名而來的武術大師，從而讓姐姐過上幸福的好日子，但姐姐卻在恢復正常后突然離他而去，他一路找尋姐姐的蹤影，逐漸揭開了十幾年前的驚天秘密……